Bonjour,
La première des choses à faire est une sauvegarde de votre site, dont vous vérifierez l'intégrité, en la ré-installant sur un site de test ; ce dernier pourra servir à effectuer les étapes ci-dessous, en prévision d'une installation définitive sur le site en production
Le processus de migration de Joomla! s'est très nettement simplifié et s'apparente à une Mise à Jour.
Vérification de l'ensemble des composants, plugins modules et template utilisés, pour VirtueMart, ont une version compatible VirtueMart 3, sous peine de dysfonctionnement de votre site, par la suite. Si ce n'est le cas, désinstallez les extensions concernées ou attendez pour votre migration.
VirtueMart 3 est compatible Joomla! 2.5 et Joomla! 3, ce qui n'est pas le cas de VirtueMart 2.6.x, et ne le sera jamais.
Aussi, en toute logique, il faut d'abord installer VirtueMart 3 (2.9.9.5, à l'heure actuelle) sur une copie de votre site (ou site miroir).